Ce site a été initié en 1997 par Patrick Saucet et Richard Varrault.
Il a été développé et mis en ligne en 1998 sous un premier nom de domaine, Waterlink.net, toujours accessible sur le web.
Le second nom de domaine, Waternunc.com, déposé en 1999, est l'url actuellement utilisée.
Plusieurs personnes sont intervenues pour donner au site l'ampleur qu'il connaît aujourd'hui : développeurs, graphistes, spécialistes de l'eau et des langues étrangères comme Alain Coulon pour le chinois et le japonais ou Yolanda Román Ortín pour l'espagnol.